安志萍:基于決策樹算法的醫(yī)療診斷決策路徑解析
一 研究背景
在當今醫(yī)療數(shù)據(jù)不斷豐富和計算能力顯著提升的背景下,傳統(tǒng)數(shù)據(jù)分析方法已難以滿足海量醫(yī)療數(shù)據(jù)的高效分析需求。因此,利用機器學習算法輔助醫(yī)療診斷逐漸成為具有廣闊應用前景的研究方向。其中,決策樹(Decision Tree)算法作為一種關鍵的數(shù)據(jù)挖掘技術(shù),憑借其模型結(jié)構(gòu)和決策過程的高度透明性(易解釋性),在分類和回歸任務中表現(xiàn)出色。它通過樹狀結(jié)構(gòu)模擬決策過程,提供可解釋性強且易于理解的分析結(jié)果,尤其適合醫(yī)療領域這種需要明確解釋模型決策依據(jù)的場景。這種透明性不僅有助于醫(yī)生和研究者深入理解數(shù)據(jù)的內(nèi)在規(guī)律,還能提高患者對診斷結(jié)果的信任度和治療依從性,從而在醫(yī)療診斷中展現(xiàn)出重要的應用價值。
決策樹算法在醫(yī)療領域的應用具有多方面的重要價值。首先,在醫(yī)學影像診斷中,決策樹能夠快速準確地從海量醫(yī)學圖像中識別異常,模擬醫(yī)生的診斷邏輯,輔助精準判斷,降低因經(jīng)驗不足導致的誤診率,同時為醫(yī)學研究提供可靠的決策支持。其次,其透明性和可解釋性是其在醫(yī)療領域廣泛應用的關鍵。決策樹通過樹形結(jié)構(gòu)清晰展示決策過程,每個節(jié)點的判斷均對應具體的醫(yī)療知識或臨床經(jīng)驗,確保決策的可追蹤性和可解釋性,這對于驗證醫(yī)療決策的合理性、控制醫(yī)療糾紛風險以及傳承和普及醫(yī)療知識具有重要意義。此外,決策樹算法在處理大規(guī)模數(shù)據(jù)集時表現(xiàn)出良好的可伸縮性,通過優(yōu)化設計能夠高效應對數(shù)據(jù)量增長,保持較高的分析性能。最后,決策樹還可通過分析電子病歷挖掘慢性病風險因素、預測治療效果,為公共衛(wèi)生管理和疾病預防提供有力支持,帶來顯著的社會價值。
綜上所述,在醫(yī)療診斷等數(shù)據(jù)分析領域,決策樹算法以其準確性、解釋性和可伸縮性等優(yōu)勢,正成為解決復雜醫(yī)學數(shù)據(jù)分析問題的重要工具。隨著技術(shù)的不斷進步和醫(yī)療數(shù)據(jù)量的日益增長,預計決策樹算法在未來的醫(yī)療領域?qū)l(fā)揮更加重要的作用。
本研究旨在探索決策樹算法在醫(yī)療診斷領域的應用,并通過對糖尿病數(shù)據(jù)集進行處理和分析,驗證決策樹算法在處理和分析醫(yī)療數(shù)據(jù)時的可行性和有效性,并對其決策路徑的透明性進行解析,探討決策樹模型在提高診斷準確性方面的潛力。
二 決策樹的相關知識
1.基本概念
決策樹是一種樹形結(jié)構(gòu)模型,形似流程圖,包含多個節(jié)點和分支。其中,節(jié)點代表數(shù)據(jù)特征或?qū)傩裕种П硎净谔卣鞯臎Q策規(guī)則,而葉子節(jié)點則包含最終的決策結(jié)果,如分類類別或回歸數(shù)值。
具體而言,決策樹由以下基本組件構(gòu)成:
(1)根節(jié)點(Root Node):作為起點,代表初始數(shù)據(jù)集,包含待分類或預測的實例。
(2)非葉子節(jié)點(Non-Leaf Node):基于特定特征的測試結(jié)果將數(shù)據(jù)分為不同分支,每個節(jié)點包含一個特征的判斷條件。
(3)分支(Branches):根據(jù)特征值的測試結(jié)果將數(shù)據(jù)集劃分為子集,每個分支對應一種可能的輸出,引導進一步的決策。
(4)葉子節(jié)點(Leaf Node):無后續(xù)分支,代表最終決策結(jié)果,如分類類別或回歸數(shù)值。
構(gòu)建決策樹的過程是從根節(jié)點開始,通過逐層判斷特征取值將數(shù)據(jù)集劃分為更小的子集,直至子集能夠被準確分類或預測。在此過程中,每個非葉子節(jié)點在樹中唯一,一旦某個特征被用于分割,后續(xù)節(jié)點不會重復使用該特征,從而確保決策路徑清晰且確定。
總體而言,決策樹模型是從數(shù)據(jù)中提取的決策規(guī)則集合,通過樹形結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)從根節(jié)點到葉子節(jié)點的決策過程,具有高度可解釋性。這一特性使其在醫(yī)療診斷等需要解釋性的應用場景中尤為重要,且易于理解和應用。
2.決策樹的分類
決策樹的不同類型和算法適用于解決各類特定的分類問題,尤其在大數(shù)據(jù)時代,合理選擇和應用這些算法能夠為醫(yī)療診斷提供有力的技術(shù)支持。通過對不同算法的選擇和優(yōu)化,可以有效提升醫(yī)療診斷的效率和準確性。
ID3算法是最早的決策樹學習方法之一,它基于信息增益準則構(gòu)建決策樹。每次遞歸選擇信息增益最大的特征進行分割,從而最大程度減少分類的不確定性。然而,ID3在處理多分類屬性數(shù)據(jù)集時存在局限性。
C4.5算法是ID3的改進版本,引入了信息增益比的概念,能夠處理包含連續(xù)值和缺失值的數(shù)據(jù)集,并支持多種輸出屬性類型。盡管如此,C4.5在處理大型數(shù)據(jù)庫時仍面臨可伸縮性問題。
CART算法適用于分類和回歸任務,采用Gini系數(shù)或信息增益比作為分裂標準。它在二元分類問題上表現(xiàn)優(yōu)異,且具有較好的可伸縮性,適合處理大型數(shù)據(jù)集。
此外,研究者們還開發(fā)了如隨機森林等新的可伸縮決策樹算法。這些算法在保持決策樹易解釋性的同時,提高了算法的可伸縮性,更適合處理大規(guī)模醫(yī)療數(shù)據(jù)。
3.決策樹的剪枝技術(shù)
決策樹的剪枝技術(shù)旨在通過簡化和優(yōu)化生成的決策樹,避免過擬合并提升模型的泛化能力。剪枝主要分為前剪枝和后剪枝兩種方式。
前剪枝在決策樹生長過程中,當滿足特定條件(如信息增益或信息增益比低于閾值)時提前終止樹的生長。這種方法簡單高效,但可能因過早停止生長而導致信息丟失,影響模型性能。
后剪枝則是在決策樹完全生長后,通過移除一些子樹并用葉子節(jié)點替代,以簡化樹結(jié)構(gòu)。這些葉子節(jié)點的分類結(jié)果通常基于子樹中多數(shù)樣本的類別。后剪枝保留了更多原始信息,能更有效地提升泛化能力,但計算成本較高,因為它需要多次遍歷訓練集。
盡管后剪枝通常能獲得更優(yōu)的模型,但其計算資源消耗也更大。因此,在實際應用中需要權(quán)衡剪枝策略,選擇合適的方法來確定剪枝程度。通過優(yōu)化剪枝過程,在保留關鍵信息的同時降低決策樹的復雜度,不僅可以提高模型的泛化能力,還能增強模型的可解釋性,使其更易于理解和應用。
三 決策樹算法的可解釋性分析
1.決策樹的結(jié)構(gòu)可解釋性
決策樹的可解釋性體現(xiàn)在其透明且直觀的決策過程,以及能夠清晰呈現(xiàn)特征間關系的結(jié)構(gòu)。
首先,決策樹的每個節(jié)點對應一個特征的測試,每個分支對應特征的不同取值。當對新樣本進行分類時,樣本從根節(jié)點出發(fā),依據(jù)特征取值沿分支向下移動,直至到達葉節(jié)點,葉節(jié)點所代表的類別即為樣本的預測結(jié)果。這一過程類似于逐步回答問題并得出結(jié)論,每一步都清晰可解釋。
其次,決策樹的分支結(jié)構(gòu)直觀地揭示了特征之間的相互影響。在良好構(gòu)建的決策樹中,從左到右瀏覽即可觀察到特征如何引導決策路徑,這種可視化的邏輯便于專業(yè)人士進行模型解釋和驗證,尤其在醫(yī)療診斷領域,決策樹能夠清晰展示診斷判斷的依據(jù)。
此外,決策樹以樹狀圖的形式呈現(xiàn),這種圖形化表達直觀展示了樹的結(jié)構(gòu)、節(jié)點的劃分規(guī)則以及葉節(jié)點的分類結(jié)果,使得即使是沒有技術(shù)背景的人也能輕松理解模型的決策邏輯。
2.決策樹的規(guī)則可解釋性
決策樹因其直觀透明的結(jié)構(gòu),具有良好的規(guī)則可解釋性,尤其在醫(yī)療診斷領域表現(xiàn)出顯著優(yōu)勢。
首先,決策樹以樹狀圖形式模擬人類決策過程,其每個分支代表影響疾病診斷的關鍵因素,每個葉節(jié)點則對應最終診斷結(jié)果。這種結(jié)構(gòu)與醫(yī)生的診斷思維高度契合,通過“如果……那么……”的邏輯形式,將診斷過程條理化、具體化。
例如,在某種疾病的診斷中,決策樹的第一個節(jié)點可能是患者年齡。若患者為兒童,則進入相應分支,表明年齡對疾病診斷具有重要影響。隨后,模型會進一步考慮癥狀或檢查結(jié)果等特征,逐步細化診斷路徑。這些決策點基于大量歷史數(shù)據(jù)和統(tǒng)計分析,確保了診斷的科學性和準確性。
決策樹的規(guī)則可解釋性優(yōu)勢在于其決策過程可追蹤,每條路徑都能轉(zhuǎn)化為清晰的決策規(guī)則。例如,若診斷某種疾病時首先考察“年齡”,則規(guī)則可能是“如果患者年齡小于18歲,則進行X檢查”,這種規(guī)則不僅易于專業(yè)人士理解,也便于非專業(yè)人士接受。
綜上所述,決策樹的規(guī)則可解釋性是其在醫(yī)療診斷等領域的重要優(yōu)勢。它以直觀、邏輯性強的方式呈現(xiàn)決策過程,有助于提升非專業(yè)人士的理解度和專業(yè)人士的決策效率。然而,也需注意其內(nèi)在復雜性,合理解釋和應用模型,以充分發(fā)揮其價值。
3.決策樹可解釋性的評估方法
評估決策樹的可解釋性可從以下幾方面展開:
(1)結(jié)構(gòu)分析:高質(zhì)量的決策樹應具備清晰的分支條件和決策路徑。通過文字描述或圖形化展示,可直觀呈現(xiàn)每個節(jié)點的決策邏輯及從根節(jié)點到葉節(jié)點的完整決策過程。
(2)特征重要性評估:在決策樹中,信息增益較大的特征通常被選為更靠前的分支依據(jù),這些特征在模型中更為顯著,反映了其對決策過程的重要性。
(3)后處理解釋方法:借助后處理工具(如SHAP)增強可解釋性,為每個預測提供局部解釋,明確決策樹對個體分類的依據(jù)。
(4)專家評審:專家意見是評估可解釋性的重要參考,他們對應用場景和決策邏輯的深刻理解可為模型提供權(quán)威評價。
(5)敏感性分析:通過改變輸入特征的值,觀察決策樹的反應,幫助理解決策樹在特定條件下的變化和決策依據(jù)。
四 決策樹算法在醫(yī)療診斷中示例應用
本研究基于決策樹算法構(gòu)建糖尿病預測模型,采用ID3算法計算數(shù)據(jù)集中各特征變量的信息增益,并選擇信息增益最大的變量作為節(jié)點,構(gòu)建樹狀結(jié)構(gòu)的決策樹。為避免過擬合,引入ccp_alphas路徑剪枝方法進行后剪枝處理。通過對比未剪枝與剪枝后模型的性能,驗證后剪枝技術(shù)在緩解過擬合方面的有效性,并提升模型的整體性能。最終,通過決策樹可視化直觀呈現(xiàn)清晰的決策路徑,生成可解釋的診斷路徑,驗證模型的準確性和應用價值。技術(shù)工具采用:Python 3.7+PyCharm 2022.2(Community Edition)。
1.數(shù)據(jù)集介紹
該數(shù)據(jù)集來自Kaggle,包含768個樣本,其中糖尿病患者268例,占比34.9%。數(shù)據(jù)集共有8個特征變量,包括:懷孕次數(shù)(Pregnancies)、血糖濃度(Glucose)、血壓(BloodPressure)、皮膚厚度(SkinThickness)、胰島素濃度(Insulin)、身體質(zhì)量指數(shù)(BMI)、糖尿病家族史函數(shù)(DiabetesPedigreeFunction)和年齡(Age),以及1個目標變量Outcome(0表示無糖尿病,1表示有糖尿病)。
2.描述性分析
首先對數(shù)據(jù)集進行描述性分析。如圖1表格所示,數(shù)據(jù)集各特征值的統(tǒng)計量已列出,且確認無缺失值。圖2按目標變量(是否患有糖尿病)進行分類,計算各特征變量的均值。結(jié)果顯示,無糖尿病群體的所有特征均值均較低,其中血糖濃度(Glucose)和胰島素濃度(Insulin)的差值尤為顯著。
3.醫(yī)療診斷模型的構(gòu)建與評估
如圖所示,采用決策樹構(gòu)建糖尿病分類診斷模型時,數(shù)據(jù)集按30%的比例劃分為訓練集和測試集。模型在訓練集上的各項性能指標均達到100%,而在測試集上顯著下降,尤其是準確率(Accuracy)僅為70.1%。這表明決策樹模型存在一定的過擬合現(xiàn)象。
為緩解過擬合,采用ccp_alphas路徑剪枝方法優(yōu)化決策樹。結(jié)果顯示,剪枝后決策樹的深度和葉子節(jié)點數(shù)量顯著減少,而模型準確率提升至77%。這表明剪枝技術(shù)在提升模型性能方面具有顯著效果。從分類報告可知,該模型存在一定的漏診(將糖尿病患者誤判為非患者)和誤診(將非糖尿病患者誤判為患者)。
4.決策路徑可視化
下圖為糖尿病數(shù)據(jù)集的特征重要性分析及診斷模型的決策路徑可視化。圖中結(jié)構(gòu)清晰,決策規(guī)則一目了然,直觀呈現(xiàn)了糖尿病診斷過程中各特征值的決策依據(jù)。這種透明性不僅凸顯了決策樹模型的優(yōu)勢,結(jié)合特征重要性分析后,更成為醫(yī)生的有力輔助工具。
五 研究總結(jié)
由于糖尿病預測是一個典型的不平衡分類問題,正負樣本比例的不均衡增加了模型構(gòu)建的難度。本研究同時采用決策樹與XGBoost集成算法進行分類預測,準確率達到77%;而隨機森林的準確率為76%。對于復雜的醫(yī)學診斷任務而言,77%的準確率已屬較為理想的結(jié)果。然而,醫(yī)學領域的特殊性要求我們不能僅關注準確率。在醫(yī)學診斷中,漏診和誤診的代價極高,因此還需綜合考慮召回率、精確率和F1分數(shù)等指標。
鑒于此,該模型可用于初步篩查或預問診場景,但在臨床診斷中應用時,仍需進一步研究以提升準確率。未來研究可從優(yōu)化特征工程、模型調(diào)優(yōu)和數(shù)據(jù)處理等方面入手,以進一步提高模型性能。
綜上所述,基于決策樹的機器學習算法在醫(yī)療診斷領域的應用研究表明,該算法不僅能提供高準確性的診斷結(jié)果,還能提供可解釋的決策過程。這對于提升患者的治療效果和醫(yī)療系統(tǒng)的決策質(zhì)量具有重要意義。因此,決策樹算法在醫(yī)療領域的研究和應用具有重要的理論和實踐價值。
作者簡介
安志萍,高級工程師,在職博士學歷,專業(yè)技術(shù)上校退役。CHIMA委員,中國研究型醫(yī)院學會醫(yī)療信息化分會理事,中國醫(yī)療保健國際交流促進會醫(yī)學工程與信息學分會委員,中國醫(yī)學裝備協(xié)會醫(yī)院物聯(lián)網(wǎng)分會委員。長期從事醫(yī)院信息化建設工作。作者觀點純屬與同行做技術(shù)交流,歡迎批評指正。